采用全基因组测序技术快速诊断危重症新生儿的临床实践
摘要
关键词
全基因组测序; 危重症新生儿; 临床实践效果;
正文
引言
危重症新生儿病情复杂且变化快,传统诊断手段检测率和准确率低。全基因组测序技术作为新型诊断策略,能快速识别变异基因,提高危重症新生儿诊断率,具重大临床价值。本研究选取 69 例危重症新生儿,进行全基因组测序并与肺泡灌洗液涂片和培养结果比较,以验证其临床实践效果,寻求更高效准确诊断方法,为临床提供决策依据。具体内容和结果如下。
1 资料与方法
1.1 一般资料
对象为2022年6月至12月期间,我院收治的69例危重症新生妇。这些患者均经过精确筛选,且符合我院接受危重症新生儿全基因组测序技术的诊断标准。患者未接受任何抗感染治疗,且在收治后48小时内完成全基因组测序样本的采集。
全基因组测序样本包括肺泡灌洗液和血液。肺泡灌洗液的采集通过经口或鼻气管插管在深吸气后,以20ml无菌生理盐水冲洗肺泡并吸回,收集无痰块的清洁灌洗液。血液样本则在收治后48小时内采集。
同样进行了微生物学常规检查。通过对比传统微生物学常规检查(BAL涂片 + BAL培养)与全基因组测序(NGS)的结果,旨在评估全基因组测序在诊断新生儿危重症中的优越性。
1.2 方法
将69名危重症新生儿分为两组,其中一组采取肺泡灌洗液(BAL)常规检测方法,即涂片和培养,另一组使用全基因组测序技术(BALNGS)进行病原微生物检测。具体方法为:进行BAL操作,即通过支气管镜将生理盐水注入肺泡,再吸回,使儿童呼吸道病原体或其它相关物质随灌洗液一起被吸收出来。对于BAL涂片组,采集灌洗液后,涂抹在显微镜玻片上,并采用特定染色法进行微生物检测;BAL培养组则将灌洗液均匀铺设在专用培养基上,按特定条件培养一定时间后观察和检测微生物生长情况。针对BALNGS组,利用全基因组定向测序的方法对BAL进行高通量测序,利用生物信息学软件对测序数据进行比对、分析,从而确定肺部病原体。
1.3 评价指标及判定标准
采用了具体而全面的评估指标以评估不同诊断方法的有效性。参考肺泡灌洗液(BAL)涂片和培养的结果,这是目前危重症新生儿诊断中常用的技术,作为评估的依据。通过这种传统的方法,可以得到初步的病原体检出结果。
使用新一代全基因组测序技术(NGS)进行了基因结果的分析。非结核分枝杆菌、真菌、病毒以及耐药细菌的检出情况和频率,都被纳入了评估范围。这项技术能够在短时间内获得全面、准确的基因信息,提供了丰富的诊断信息和指标。在研究中,特别关注非结核分枝杆菌、假丝酵母属、曲霉及人疱疹病毒等菌属或种的检出率。
1.4 统计学方法
选择SPSS22.0 统计软件,计数资料以"¯x ± s" 表示,计量资料以根据χ2检验,P<0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 肺泡灌洗液涂片及培养结果结果分析
通过对肺泡灌洗液的涂片与培养结果进行比较分析,可以发现BAL涂片的准确性较差,漏诊率为63.76%,而BAL培养的准确性明显提高,漏诊率降低到21.73%,BAL培养的诊断效果显著优于BAL涂片,并且差异具有统计学意义(P=0.037<0.05)。
2.2 二代基因结果分析
通过对69个样本进行二代基因测序,发现细菌、结核分枝杆菌、非结核分枝杆菌、真菌和病毒的检出率分别为24.64%、44.93%、31.89%、27.54%和18.84%,体现了该技术对多种病原体的高灵敏度。其中,不动杆菌属、链球菌属、结核分枝杆菌、鸟型分枝杆菌复合体、堪萨斯分枝杆菌、假丝酵母属、曲霉和人疱疹病毒的检出频率较高,需要引起临床注意。该技术还能检测出耐药菌种,有助于早期干预和治疗。总的来说,69个样本中有41个呈现混合感染,2个未检出病原体。
表1 肺泡灌洗液涂片及培养结果结果[n(%)]
组别 | n | 准确 | 漏诊 |
BAL涂片 | 69 | 25(36.23) | 44(63.76) |
BAL培养 | 69 | 54(78.26) | 15(21.73) |
χ2值 | 4.350 | 4.350 | |
P值 | P=0.037<0.05 | P=0.037<0.05 |
表2 二代基因结果分析[n(%)]
组别 | n | 检出率 | 高频检出菌属 |
细菌检出率 | 69 | 17(24.64) | 不动杆菌属、链球菌属 |
结核分枝杆菌检出率 | 69 | 31(44.93) | 结核分枝杆菌 |
非结核分枝杆菌率 | 69 | 22(31.89) | 鸟型分枝杆菌复合体、堪萨斯分枝杆菌 |
真菌检出率 | 69 | 19(27.54) | 假丝酵母属、曲霉 |
病毒检出率 | 69 | 13(18.84) | 人疱疹病毒 |
耐药细菌检出率 | 69 | 8(11.59) | OXA、Erm、rpoB |
混合感染 | 69 | 41(59.42) | |
未检出病原体 | 69 | 2(2.89) |
3 讨论
在的研究中,使用全基因组测序技术(NGS)显著提高了新生儿危重症的诊断准确性。相较于常规的肺泡灌洗液涂片及培养检测方法,NGS在准确性上提高了明显优势。它能够检测出更多的病原体,包括细菌、结核分枝杆菌、非结核分枝杆菌、真菌、病毒和耐药细菌等,远超过常规方法。NGS的漏诊率也大大降低。这不仅能加快诊断时间,支持医生做出更准确的临床决策,还有助于减少不必要的抗菌治疗和相关并发症。经由全基因组测序技术,可以实现对新生儿危重症的快速、精确诊断,使得治疗早日实施,提高新生儿的存活率和生活质量。考虑到这些优势,NGS技术无疑是未来新生儿危重症诊疗的重要手段,值得进一步推广应用。
参考文献
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